棘皮动物分会于2013年11月在山东青岛成立，发起人为杨红生、董双林、常亚青等，挂靠单位为中国科学院海洋研究所。

棘皮动物属原始后口动物无脊椎动物的最高等类群，处于由无脊椎动物开始向脊椎动物分支进化的阶段。我国棘皮动物学研究始于20世纪30年代，系统研究了棘皮动物起源与分类、生物学、遗传学、生态学等特征，开展了刺参、海胆等经济物种的规模化繁育、增养殖和产品加工相关理论与技术等研究。近20年来，发表论文2000余篇，授权专利1400余项，出版多部海参、海胆等相关专著，获得多个国家和省部级奖励。

棘皮动物分会作为从事棘皮动物教育、科研、生产等人才的交流平台，重点致力于组织棘皮动物科学重点学术课题的学术研讨会、学术报告以及科学考察活动，促进学科发展；加强国内与国际范围内棘皮动物研究的广泛与深入交流，把握棘皮动物研究的前沿动态和发展方向；在社会广泛普及棘皮动物科普知识、传播创新的科学思想和方法、推广先进的应用技术，促进“产学研”合作，加快科研成果转化，服务产业和社会，为环境保护和产业发展提供理论和技术支撑。